木兰寺建成后，人们将敬仰的女英雄韩娥供奉在寺庙里，追其为“昭武将军”。

二、新都木兰寺的沿革

木兰寺的开建。《木兰镇志》第307页作了记载：木兰寺建于明神宗万历年间（1576年左右），马、韩两姓倡议修建寺庙，纪念女扮男装从军报国的巾帼英雄韩娥，新都父老群起响应。他们在南关外选择赤岸山为寺址，建成木兰寺，供奉韩娥，谥号武昭将军。当时寺院拥有四十八殿，山门开在一里开外的箢篼山，寺院范围方圆数里，是省内省外的一座名寺。

明朝时有龙门塔和滚钟坡。明末清初的时候，木兰寺和龙门塔毁于兵燹。 木兰山、木兰村，清初属华阳县九区隆兴镇勇字团。清康熙四十五年（1705年）时，从湖广、江西、广东、陕西、福建等省相继移居新都的客家人，出于对中原木兰传说的认同以及对蜀中木兰韩娥的敬仰，积极响应邑人古成魁、鞠仲高等十一人的倡议，集资重建木兰寺。

木兰寺的修建规模，据清道光《新都县志》卷六载：木兰寺“殿五重，周回墙”。又据《木兰镇志》记载：当时修建规模为六进八殿。六进是：一进为戏台；二进为马灵官殿；三进为灵官殿；四进为观音殿；五进为鲁班殿、关圣帝君殿；六进为大殿，右侧木兰殿、左侧孔夫子殿；大殿右侧与木兰殿之间是厢房，内植金桂、玉兰、海棠、紫罗兰等名贵花木。庙内各殿前两侧也分别栽植香樟、罗汉松等名木。庙宇四周修了围墙，庙外栽植了很多柏树。

木兰寺重建后，新都龙门书院主讲李琲，在秋日游木兰寺后写了一首五言诗《秋日游木兰寺》，这是迄今为止发现的最早的一首以木兰寺为名写的古体诗：

久仰仙台迹，乘秋晓日晴。苍松环灵秀，翠柏引风情。

怀古穷何病，传今有学成。欢余还自愧，无志负神京。

后来，木兰寺又被毁坏。清乾隆十一年（1746年）再次重修。清嘉庆《新都县志·寺观志》记载了这件事：木兰寺在县南十里龙门山，乾隆十一年重修。到清乾隆三十五年（1770年）再次维修；清嘉庆十一年（1806年）时又进行了维修，并建成十方丛林。1914年，民国新都政府重建木兰殿。清代和民国时期，新都先后四次规模较大重建和维修木兰寺，是人民对巾帼英雄蜀中木兰韩娥发自内心的崇敬和深深的纪念。

二十世纪三四十年代，军阀和国民政府的军队先后入驻木兰寺，殿房毁坏十分严重。1949年后，木兰寺被改建为木兰第二小学，木兰寺大殿等部分庙堂得以保存。1954年，木兰村划归新都县木兰乡。1974年，木兰寺大殿和房屋被全部拆毁。1999年，新都镇正因寺拆除后，部分材料搬到木兰寺旧址。2001年9月，新都区重建木兰寺。

清康熙四十五年（1705年）时，山上仍有清泉，每岁不枯。乾隆年间，木兰殿侧那眼凿于明神宗万历年间的古井“通天井”仍然存在。人们采取围塘建井的方法，对古井进行了扩建。围绕古井四周又修建了一口新井，将古井套在新井中，上下两井重叠，中间以石板相隔，形成井中有井的奇妙建筑。丰水期，僧侣们在上井口汲水；枯水期则掀开石板，露出下井，在下井口的古井中汲水。井水四季清澈，不溢不涸。“通天井”废于1975年，现仅存遗址。